Gli enti che compongono il SNPA (Ispra, Arpa, Appa) hanno importanti competenze in materia di monitoraggio della qualità delle acque superficiali (fiumi, laghi, acque di transizione), ma anche per le acque sotterranee e, per alcuni aspetti – con differenze fra una regione e l’altra – per quelle potabili. Sempre più attenzione viene dedicata anche al tema degli inquinanti emergenti, quali, ad esempio i Pfas. Nel giugno 2019 è stato pubblicato il primo rapporto sulla presenza di queste sostanze su tutto il territorio nazionale. Fra i temi affrontati nel 2019 anche la presenza di glifosate e microplastiche nelle acque. Prodotte anche linee guida per la scelta dei metodi analitici per determinare le sostanze prioritarie.
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